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Gaussian向け量子化学計算用マシン

2025年6月9日 テガラ株式会社 研究用ワークステーション, 医学・看護学・薬学, 生物学・農学, 研究開発用PC 構成事例 (テグシス), テガラからのお知らせ

材料・物質の開発研究に携わるお客様より、Gaussian等の量子化学計算を想定して試算したモデルPC構成では、税込み160万円の予算を超えてしまったため、予算内で快適に動作する構成をご提案いただきたい、とのご依頼をいただきました。
お客様の構成シミュレーションは下記の通りです。

CPU :Intel Xeon Gold 5520+ 2.20GHz (TB 4.00GHz) 28C/56T x 2基構成
メモリ:合計256GB DDR5 5600 REG ECC 16GB x 16
GPU:NVIDIA RTX A400 4GB (MiniDisplayPort x 4)
ストレージ:1TB SSD S-ATA
電源:1000W 80PLUS PLATINUM
OS:Microsoft Windows 11 Pro for WS 64bit

ご連絡いただいた内容を踏まえ、弊社からは下記の構成をご提案しました。

CPU AMD Ryzen Threadripper 7970X 4.00GHz (boost 5.3GHz) 32C/64T
メモリ 合計256GB DDR5 5600 REG ECC 64GB x 4
ストレージ1 1TB SSD S-ATA
ビデオ NVIDIA RTX A400 4GB (MiniDisplayPort x 4)
ネットワーク on board (2.5GbE x 1 10GBase-T x 1) Wi-Fi
筐体+電源 ミタワー型筐体 1000W 80PLUS PLATINUM
OS Ubuntu 24.04

ご連絡いただいたご希望要件に合わせて構成を検討しました。

Gaussian 16は、分子構造の最適化やエネルギー解析などを行う量子化学向けのソフトウェアで、研究や開発の現場で広く活用されています。
この種の処理は負荷が高く、効率よく運用するにはシステムのスペックが重要です。
本ソフトウェアは、マルチスレッドによる並列実行を活用することで、処理時間を大幅に短縮できます。

構成について

並列処理機能を最大限活用するため、ご希望の金額内で可能な限りコア数を確保できる「AMD Ryzen Threadripper 7970X 4.00GHz (boost 5.3GHz) 32C/64T」を採用しました。

Gaussian 16で原子数50以上または基底関数500以上の計算を行う場合は、1コアあたり4GB以上のメモリを実装することが推奨されています。
メモリは余裕をもって256GB搭載しており、高負荷な処理にも対応可能です。

本仕様で採用しているマザーボードは、最大で4枚までのメモリを実装できます。
さらに容量を増やす場合は、現在のモジュールをすべて容量の大きいものに交換する必要があります。

ご参考までに

本ケースではお客様のご予算の範囲内でストレージの性能向上や容量の拡張を図ることで、より安定した運用環境を構築することもできます。

弊社は Gaussian 16をはじめ、材料工学やマテリアル研究など、他の高度な計算ソフトに適したシステムをご提案しています。
それぞれの手法に適したPCスペックについては、以下のページで詳しくご紹介しています。

ご予算やご使用のソフトウェア、運用方法に合わせて最適なパーツ構成をご提案いたします。掲載内容とは異なる条件でご検討の場合でも、お気軽にご相談ください。

キーワード

・Gaussianとは

Gaussianは、米国のGaussian社の開発する計算化学用ソフトウェア。
電子構造や分子特性などの予測計算が可能であり、量子化学計算や分子動力学計算に限らず、様々な用途で利用される。

参考: Gaussian ※外部サイトに飛びます

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Gaussian向け量子化学計算用マシン

※事例の名称またはご希望の条件などをご記入ください。

  • 量子化学計算
  • Gaussian

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